聚酯薄膜的海关编码是39209990,建议查看中国海关总署官网获取最准确的信息,同时请注意,海关编码可能因产品种类、成分含量等不同有所区别,因此在实际申报时,应提供准确的商品信息以便确定对应正确的海关编码。